Patch 1.06 für Codename: Panzers - Phase Two bringt den kooperativen Mehrspieler-Modus, der schon aus dem ersten Teil des Spiels bekannt ist. Nachdem man eine Karte im Singleplayer-Part gewonnen hat, steht sie hinterher als Koop-Karte zur Verfügung. Während der gemeinsamen Missionen gibt es allerdings keine Pause- und Speicherfunktion. Darüber hinaus enthält der Patch neue Mehrspielerkarten und behebt einige kleinere Fehler. Im Mehrspielermodus gibt es zum Beispiel jetzt auch eine Einheitenbegrenzung, um Lags in den Griff zu bekommen.